コマンドpause の使い方は2種類あります.
ひとつめは,
pause 数 [Enter]というものです. これは, 「数」の部分に指定された秒だけ gnuplotの実行を中断します.
ふたつめは,
pause -1 [Enter]というものです. これは, [Enter]キーが押されるまで実行を中断します.
実行を中断しているときに何かメッセージを表示したいときには,
pause 数 '表示するメッセージ' [Enter]あるいは
pause -1 '表示するメッセージ' [Enter]のように, 表示したいメッセージを単一引用符で囲って指定します.